Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttc21bQ0HA38 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc21bQ0HA38 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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