Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
MitfQ08874 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MitfQ08874 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms