Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MestQ07646 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
MestQ07646 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
MestQ07646 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
MestQ07646 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms