Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col17a1Q07563 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col17a1Q07563 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms