Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cntn3Q07409 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms