Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gdf9Q07105 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gdf9Q07105 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms