Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Siah2Q06986 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms