Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox12Q04890 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms