Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox9Q04887 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox9Q04887 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms