Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox8Q04886 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms