Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Top1Q04750 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Top1Q04750 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Top1Q04750 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms