Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smpd1Q04519 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms