Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RelaQ04207 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms