Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pfdn6Q03958 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pfdn6Q03958 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms