Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Crisp3Q03402 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms