Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ddr1Q03146 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddr1Q03146 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms