Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a2Q02788 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms