Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GscQ02591 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GscQ02591 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GscQ02591 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GscQ02591 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GscQ02591 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms