Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkcqQ02111 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms