Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ascl1Q02067 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms