Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sec23aQ01405 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms