Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
EgfrQ01279 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EgfrQ01279 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms