Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoa1Q00623 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoa1Q00623 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms