Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F8a1Q00558 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms