Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
rp9P97762 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
rp9P97762 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
rp9P97762 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
rp9P97762 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
rp9P97762 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms