Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Polr2cP97760 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2cP97760 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms