Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pitx2P97474 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms