Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Npas2P97460 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Npas2P97460 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Npas2P97460 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms