Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sec1P97353 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sec1P97353 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms