Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TgfbiP82198 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfbiP82198 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TgfbiP82198 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfbiP82198 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfbiP82198 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TgfbiP82198 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TgfbiP82198 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TgfbiP82198 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TgfbiP82198 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms