Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabpb2P81069 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms