Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Polr1bP70700 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Polr1bP70700 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms