Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ldb1P70662 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ldb1P70662 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.6 ms