Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rad50P70388 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rad50P70388 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms