Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msx3P70354 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msx3P70354 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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