Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp7P70280 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp7P70280 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms