Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tuba4aP68368 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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