Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Acta1P68134 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms