Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps17P63276 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps17P63276 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms