Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb3P63080 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb3P63080 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms