Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl39P62892 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl39P62892 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms