Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab3cP62823 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab3cP62823 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms