Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufm1P61961 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ufm1P61961 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ufm1P61961 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms