Protein–RNA interactions for Protein: P61294

Rab6b, Ras-related protein Rab-6B, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6bP61294 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6bP61294 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms