Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PlnP61014 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PlnP61014 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PlnP61014 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PlnP61014 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms