Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarf2P59222 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf2P59222 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms