Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tpm2P58774 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms