Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gsc2P56916 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms