Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Bace1P56818 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Bace1P56818 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms