Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Faf1P54731 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Faf1P54731 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Faf1P54731 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms